De kapel werd in het verleden gebruikt voor dagelijkse gebeden en kerkdiensten. Weeskinderen namen hier verplicht deel aan religieuze bijeenkomsten. Het Weeshuis had, vond men, niet alleen een verzorgende, maar ook een opvoedkundige en religieuze taak.
Tegenwoordig heeft de kapel geen religieuze functie meer, maar wordt de ruimte vaak gebruikt voor tentoonstellingen. De KunstKapel is bedoeld voor exposities van lokale kunstenaars of bijzondere Culemborgse projecten.
